Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col4a3Q9QZS0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Col4a3Q9QZS0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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