Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hacd1Q9QY80 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms