Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Tgm1Q9JLF6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm1Q9JLF6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms