Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtsmQ9JL96 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms