Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ldb3Q9JKS4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms