Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Mrpl39Q9JKF7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Mrpl39Q9JKF7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Mrpl39Q9JKF7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Mrpl39Q9JKF7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl39Q9JKF7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms