Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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