Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ms4a4bQ9ES61 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ms4a4bQ9ES61 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ms4a4bQ9ES61 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ms4a4bQ9ES61 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ms4a4bQ9ES61 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms