Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hmg20aQ9DC33 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hmg20aQ9DC33 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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