Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf6Q9DBU5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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