Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Med27Q9DB40 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med27Q9DB40 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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