Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ift43Q9DA69 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms