Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms