Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem54Q9D7S1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tmem54Q9D7S1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tmem54Q9D7S1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tmem54Q9D7S1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tmem54Q9D7S1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem54Q9D7S1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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