Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc167Q9D162 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms