Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gtpbp8Q9CY28 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gtpbp8Q9CY28 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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