Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sgo1Q9CXH7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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