Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms