Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkrip1Q9CWV6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms