Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccer1Q9CQL2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccer1Q9CQL2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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