Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q9CQC3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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