Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NsmfQ99NF2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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