Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprtQ99M80 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms