Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Nus1Q99LJ8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Nus1Q99LJ8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nus1Q99LJ8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nus1Q99LJ8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nus1Q99LJ8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nus1Q99LJ8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Nus1Q99LJ8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Nus1Q99LJ8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Nus1Q99LJ8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Nus1Q99LJ8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Nus1Q99LJ8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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