Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5lQ99LH9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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