Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TrabdQ99JY4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrabdQ99JY4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms