Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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