Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med28Q920D3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms