Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Dkk4Q8VEJ3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms