Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc115Q8VE99 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccdc115Q8VE99 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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