Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sft2d2Q8VD57 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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