Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8VCE4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q8VCE4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms