Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ClmpQ8R373 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ClmpQ8R373 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms