Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssh3Q8K330 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms