Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG19

Ltbp1, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp1Q8CG19 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp1Q8CG19 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp1Q8CG19 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms