Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc178Q8CDV0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms