Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc38Q8CDN8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc38Q8CDN8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc38Q8CDN8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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