Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4aQ8C9S8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4aQ8C9S8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms