Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp44Q8C2S0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp44Q8C2S0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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