Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FarsaQ8C0C7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FarsaQ8C0C7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FarsaQ8C0C7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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FarsaQ8C0C7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FarsaQ8C0C7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms