Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtpaQ8BWP5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtpaQ8BWP5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms