Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmod1Q8BVA4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms