Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdca8Q8BHX3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms