Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Liat1Q810M6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Liat1Q810M6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms