Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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ChfrQ810L3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ChfrQ810L3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms