Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Uhrf2Q7TMI3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms