Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GcsamQ6RFH4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms