Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trak1Q6PD31 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms