Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms