Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms